FCPE bietet eines der Tools, die von Wissenschaftlern auf der ganzen Welt für die Analyse von Genen verwendet.

-Blast2GO erlaubt, um eine große Menge von Daten schnell und einfach zu analysieren

-der Roslin-Institut in Edinburgh verwendet die Anwendung in ihre genetischen Studien

-Zugang ist kostenlos und offen für die wissenschaftliche Gemeinschaft über die FCPE-Website

ValenciaOktober 2009.- Wissenschaftler von der Abteilung Bioinformatik Research Center Prinz Philip haben einen Computer entwickelt Tool Analyse von Genen wurde zu einem der am häufigsten genannten in seiner Kategorie, und daher eine der am häufigsten verwendet, von anderen Forschern in den Ergebnissen ihrer KunstWissenschaftler Arsch.

Das Tool ist mit dem Namen Blast2GO und wird im Bereich der Genomikforschung verwendet, um die Funktion unbekannte Gene vorherzusagen. Derzeit führt Forschung Genom zu eine riesige Datenmenge auf Tausenden Genen extrahiert aus Prüfungen, die Sequenzierung; und der einzige Weg, um mit ihnen zu arbeiten ist durch Computer-Methode kann die Funktion dieser Gene bestimmt.

Blast2GO dient dazu, eine erste Vorhersage der Funktion von Genen gefunden zu entwickeln, und macht es einfach, eine große Menge von Daten dank Bioinformatik zu behandeln.

Der Direktor des Centro de Investigación Príncipe Felipe, Rubén Moreno, verweist darauf, dass dieses Tool ist ein Beispiel für die Qualität der FCPE zur Verfügung von der wissenschaftlichen Gemeinschaft, als Referenz im Bereich der Genomikforschung Beilegung stellt erweiterte Bioinformatik-Anwendungen ”.

Die Anwendung wurde von zwei Forscher der Arbeitsgruppe für Bioinformatik FCPE, Ana Conesa Wissenschaftler und Stefan Götz, entwickelt und ihre Verwendung ist kostenlos und offen für die gesamte wissenschaftliche Gemeinschaft über die FCPE-Website.

Eine Anwendung, unterstützt durch Zahlen

Der wichtigste Indikator der Effizienz und die Auswirkungen dieses FCPE Bioinformatik-Tools ist die hohe Anzahl der Zitierungen enthaltenen wissenschaftlichen Arbeiten, d. h. die Anzahl der, dass andere Wissenschaftler aus verschiedenen Zentren die Anwendung für die Analyse der Daten in ihrer Forschung verwendet haben.

Blast2GO angesammelt hat bereits rund 200 Zitate aus wissenschaftlichen Artikeln bis heute, und ist an der Spitze einer Reihe von Tools, die ähnliche Funktionen entwickeln ”, sagt den Forscher Ana Conesa.

Seit seiner Gründung im Jahr 2005 hat Blast2GO mehr als 79.000 verwendet, und es wurde für rund 4.800 Wissenschaftler auf der ganzen Welt, eine Zahl, die diese Anwendung in die am häufigsten verwendeten Satz von Tools gemacht hat, die ähnliche Analyse im Bereich der Genomikforschung ausführen verwendet. Allein in den letzten zwei Monaten haben gezählt, rund 8.000 verwendet oder die Tool-Downloads,

, Blast2GO erhält durchschnittlich 180 Besuche von Unternehmen, Universitäten und Forschungszentren auf der ganzen Welt. Von geografischen Gebieten sind die hauptsächlichen Nutzer in Europa und in Ländern wie Israel, Vereinigte Staaten.UU und Kanada. Gehören Sie auf dem asiatischen Kontinent Verwendungen von China und Japan, zusammen mit anderen Labors befindet sich in Indien, Indonesien und Thailand.

Innerhalb dieses internationalen Projektion erstreckt sich die Verwendung des Tools zu anderen Orten wie Südafrika, Australien und Argentinien. Wenn Sie die Weltkarte der Verwendung der Anwendung betrachten, sehen wir, dass er voll mit dem Planeten wo Genomforschung wird ”, sagt Ana Conesa.

Regelmäßige Besucher der Anwendung einschließen Bezugspunkte als das Roslin-Institut in Edinburgh – Center, die das Schaf Dolly-, erstellt, die eine Vereinbarung mit FCPE verwenden Sie die Anwendung in genetische Studien unterzeichnet hat. Darüber hinaus wird das Tool auch von anderen Zentren des großen Prestiges in der Genomforschung als UC Davis (UC), oder der US (United States Department der Landwirtschaft USDA) Agrarforschung-Service verwendet.

Die Bioinformatik-Anwendung stützt seine Operation auf die Kombination aus einem früheren System zur Analyse der genomic Reihenfolgen genannt BLAST ”, Darstellung und Extraktion von Informationen Computertechnologien. Blast2GO wurde zunächst konzipiert, wie eine Zusammenarbeit zwischen dem Instituto Valenciano de Investigaciones Agrarias (IVIA) und der Polytechnischen Universität Valencia (UPV), und von seiner Lage im IPPC erhebliches Wachstum in seiner Verwendung und Funktionalität erreicht hat.

das Team von Wissenschaftlern der das Labor für Bioinformatik des FCPE.

Die Gründe für den Erfolg

Im Grunde Blick auf die öffentlichen Datenbanken andere Gene Sequenz ähnlich zu charakterisieren und Analyse von Informationen über die bekannten Gene, erzeugen wir eine Vorhersage über die Rolle des unbekannten ”, Ana Conesa, sagte. Die IVU-Wissenschaftler haben diese Methode perfektioniert, so dass diese erste Prognose in einer Art und Weise sehr schnell, zuverlässig und erschwinglich genomische Forscher entwickelt.

Stefan Götz Bioinformaticist erklärt, dass das Tool ist sehr einfach zu verwenden für Biologen und zur gleichen Zeit ist äußerst leistungsfähig für ihre Fähigkeiten zur analyse von vielen Daten zur gleichen Zeit ”. Gótz sagt das extrahiert die relevanteste Informationen sehr schnell und umfangreiche Suchen und Datenverarbeitung auf zehntausende Gene angewendet ”.

Das System, das Blast2GO beschäftigt andere Elemente ausgeführt, die statistische Analysen auf die Daten über die erste Vorhersage zu entwickeln wird, helfen und, die Handhabung und Verarbeitung der Daten gesammelt die genomische Experimente. Wenn ein Forscher charakterisieren das Genom eines neuen Organismus, gefunden in der Anwendung eine freundliche und intuitives Tool zusätzlich die Möglichkeit bietet für den Vergleich der Daten zu wissen, was für Beispiel die häufigste-Funktion, ist wenn es die gleiche in ähnliche Agenturen oder haben Sie einige Funktionen, die keinen anderen ”, Ana Conesa betont.

Außerdem das Programm bietet Service für den Benutzer durch die Zweifel und Abfragen lösen. In diesem Sinne Implementierung ist in kontinuierliche Überprüfung und Verbesserung, da als Conesa, erklärte dieses Feedback ermöglicht das Tool wurde entwickelt, mit der Unterstützung der wissenschaftlichen Gemeinschaft, gemäß die Wünsche und Anregungen der Nutzer selbst ”.