NL
FR
DE
EN
ontwikkelde een softwaretoepassing die vertegenwoordiger eiwit in borst kanker metastase identificeert.
het programma classificeert cel functies meer vertegenwoordigd in verschillende soorten metastatische cellen.
Spanje, augustus 2012.- onderzoekers van het Instituut voor biomedisch onderzoek van Bellvitge (IDIBELL) een software-applicatie, genaamd MinerProt, die het mogelijk de indeling van proteïnen volgens hun functie maakt hebt gemaakt. Het systeem, gemaakt in samenwerking met onderzoekers van <? xml:namespace prefix = st1 ns = “urn: schemas-microsoft-com: office: smarttags” / >
Het team, gecoördineerd door de onderzoeker bij de Sierra Angels IDIBELL, heeft deze tool samen met eiwit-eiwit interactienetwerken gebruikt voor het maken van specifieke expressieprofielen van eiwitten voor de verschillende metastase van kanker van de borst, hersenen, longen, lever en botvaststellen van prioriteiten in elk van hen. De functionele benadering, gebaseerd op de selectie van de meest representatieve proteïne, kan dienen om te vinden van markeringen te voorspellen van de evolutie van de kanker proces, alsmede over toekomstige therapeutische doelstellingen ontwikkelen.
organoespecifica hersenen metastase netwerkmodel. Eiwitten zijn vertegenwoordigd door knooppunten en randen tussen knooppunten Toon interacties tussen de eiwitten.
De belangrijkste doelstelling van het onderzoek was op zoek naar een functionele classificatie die helpt bij het interpreteren van alle de gegevens mee betreffende eiwitten verband met metastase van borstkanker, gezien het grote aantal differentieel wordt uitgedrukt en hun complexiteit van studie. De classificatie geeft aan de cellulaire functies die meer kunnen worden weergegeven in een bepaald type van cel metastatische. Op deze functies, de classificatie vertelt ons wat eiwit kan worden belangrijker voor de functie die wij hebben geïntegreerd ”, Sierra uitgelegd, en blijft: op basis van voorheen geïdentificeerde genen/eiwitten worden ingedeeld volgens de mate van differentiële expressie (statistische significantie) te regelen dan in een eiwit-eiwit interactie netwerk. Het is een handige manier om te filteren de informatie door het selecteren van belangrijke eiwitten aan relevante functies definiëren. We een aanpak op basis van discriminatie functies van metastase van borstkanker kanker reactie op hun organoespecificidad dat zou celgroei in microenvironments van verre als bot, hersenen, lever en Long organen gevolgd ”.
Er zijn andere gelijkaardige classificeren programma’s, maar MinerProt prioriteit geeft de proteïne meer vertegenwoordiger uit elke functionele groep, die heeft bijgedragen tot het begrijpen van de moleculaire mechanismen die kenmerkend is voor de metastasen organoespecificidad ”, verklaart < st1:personname productid = “de Dr. zag.” w:st = “op” > Dr. Sierra .
Metastase hangt af van meerdere en complexe interacties. Alleen aangepast cellen hebben de capaciteit om te overleven en groeien in een verre orgel. Identificeren dodelijke interacties tussen eiwitten en eiwitten in kankercellen is een veelbelovende voor toekomstige ontwikkelingen van therapeutische doelen en meest krachtige en selectieve drugs via ”, concludeert Sierra.
Het werk, gefinancierd door
Over ons
het Instituut voor biomedisch onderzoek van Bellvitge (IDIBELL) is een centrum voor onderzoek gemaakt in 2004. Het is deelgenomen door de Universiteit ziekenhuis van Bellvitge van het Catalaans van de Health Institute, het Catalaans Instituut voor oncologie en de Universiteit van Barcelona. Gelegen in de Biopol ’ L H ’ L’Hospitalet de Llobregat en is een lid van de Campus van internationale uitmuntendheid van de Universiteit van Barcelona HUBc.
De articulo: referentie
Rebecca Sanz-Pamplona, Javier Garcia-garcia, Sergi Franco, Xavier Messenger, Keltouma Driouch, Baldo olijfbomen en Angels zag. Taxonomie van orgel-specifieke borst kanker metastasen gebaseerd op aprotein – eiwit interactie netwerk. MOL. BioSyst., 2012, 8, 2085 – 2096
